SMILES(Simplified Molecular Input Line Entry System)SMILES란?정의: SMILES는 분자 구조를 문자열 형태로 표현하는 표기법입니다.사용 목적: 분자의 정보를 간단히 표현하여 데이터로 관리하고, 컴퓨터 알고리즘에 활용할 수 있습니다.SMILES의 구성 요소원자(Atom): 각 원소를 기호로 표기.결합(Bond): 단일(-), 이중(=), 삼중(#) 결합 등으로 표기.고리(Ring): 고리의 시작과 끝을 숫자로 표시.방향족(Aromaticity): 벤젠과 같은 방향족 고리를 소문자로 표기.가지(Branch): 가지는 괄호()로 표현.SMILES의 예시Aspirin: CC(=O)OC1=CC=CC=C1C(O)=O비슷한 구조의 화합물: CCC1=CC=C(OC(C)=O..
개요과학 연구와 약물 발견 분야에서 중요한 도구 중 하나인 Discovery Studio가 2024년 버전으로 업데이트되었습니다. Discovery Studio 2024는 다양한 새로운 기능과 향상된 성능을 통해 연구자들에게 더욱 강력한 분석 및 시뮬레이션 도구를 제공합니다. 이번 블로그 글에서는 Discovery Studio 2024의 주요 기능과 장점에 대해 살펴보겠습니다.주요 특징1. 향상된 분자 시뮬레이션Discovery Studio 2024는 분자 동역학 시뮬레이션과 관련된 알고리즘을 대폭 개선하여 더욱 정확하고 신뢰할 수 있는 결과를 제공합니다. 특히, 새로운 포스필드와 시뮬레이션 기법이 추가되어 다양한 분자 시스템에 대한 예측이 더욱 정밀해졌습니다.2. 통합 데이터 분석새로운 버전에서는 데이..
제2회 GenAI 해커톤개최2024년 8월 1일기간8월1일 부터~ 9월 12일 까지참가 대상국내외 개발자, 학생, 스타트업 등총 상금1천만 원, 모든 참가자에게 100달러 상당 'Solar LLM' 크레딧 제공수상 팀추가로 5,000달러 상당의 Solar LLM 크레딧 제공심사위원업스테이지 김성훈 대표당근 김재현 CSO와 박민우 리더프라이머 권도균 대표와 노태준 파트너브레인크루 이경록 대표목표AI 창업 촉진 및 AI 인재 팀 빌딩혁신적인 AI 솔루션 발굴참가자들은 네트워킹 기회와 멘토링 제공관련기사 프라이머, '제2회 GenAI 해커톤' 개최 - 와우테일스타트업 액셀러레이터 프라이머는 인공지능(AI) 창업을 촉진하고 AI 인재들의 팀 빌딩을 목표로 한 '제2회 GenAI 해커톤'을 오는 8월 1일 개최한..
1. 실어증이란?실어증의 개념뇌 손상으로 인해 언어 능력이 손상되는 상태.말하기, 이해하기, 읽기, 쓰기 등의 언어 기능에 장애가 발생.정의 및 현황주요 원인: 뇌졸중, 외상성 뇌 손상, 뇌종양 등.한국 내 실어증 환자의 수: 2020년 기준, 뇌졸중으로 인한 실어증 환자는 약 3만 명 추정 (출처: 대한신경과학회).실어증은 남녀노소를 불문하고 발생 가능.실어증의 원인에 따른 종류브로카 실어증 (운동 실어증)위치: 좌측 대뇌 반구의 브로카 영역.증상: 유창하지 못한 말투, 단어 찾기 어려움, 문법 오류.이해 능력은 비교적 양호하지만 복잡한 문장은 이해하기 어려움.베르니케 실어증 (감각 실어증)위치: 좌측 대뇌 반구의 베르니케 영역.증상: 유창한 말투지만 의미 없는 말, 이해력 저하.자신이 말하는 내용을 ..
1. 튜토리얼 및 준비물- ChatGPT를 활용해 zero shot으로 간단한 앱 만들어보기- QA 에 대한 평가 지표를 비교하고 보고서를 만들어 word 파일로 저장시키는 앱- 준비물 두 시스템에 대한 평가 지표- 사용된 평가지표1) answer_similarity2) answer_correctness- sample_rag: RAG 시스템에 대한 평가표- sample_default: 기본 GPT 시스템에 대한 평가표 2. Zero Shot 쿼리 짜기첨부하는 두개의 성능 결과 csv 파일을 업로드 하고 비교평가 하여 word 파일로 저장시키는 flask 앱 만들어줘. 참고 사항은 아래와 같아 --- question은 동일해 따라서 해당 칼럼이 key야. --- answer_similarity와 ans..
제 2회 AI 신약개발 경진대회: JUMP AI 2024제 2회 AI 신약개발 경진대회, JUMP AI 2024가 곧 시작됩니다! 이번 대회는 신약 개발을 위한 AI 모델 개발을 촉진하고 신약 연구자들의 연구 의욕을 고취시키기 위한 목적으로 개최됩니다. 한국제약바이오협회와 AI신약융합연구원이 주최하는 이번 대회에 많은 관심과 참여 부탁드립니다.대회 개요주제: IRAK4 IC50 활성값 예측 모델 개발목적:AI 신약개발 생태계 활성화신약 연구자들의 연구 의욕 고취신약개발에 참여할 젊은 인재 발굴일정대회 시작: 2024년 8월 5일 (월)대회 종료: 2024년 9월 23일 (월)코드 및 발표자료 제출 마감: 2024년 10월 4일 (금)코드 평가: 2024년 10월 7일 (월) ~ 10월 18일 (금)발표 ..
1. ADMET 데이터 101- 한국제약바이오협회 무료 강의- 이수증 있음2. 강좌 소개강의시간강의내용실습여부1물리화학적 데이터 이해 - 용해도 연관 물리화학적 성질N - 해리 상수 (pKa)에 따른 분배 계수 및 용해도의 변화2유기 분자와 무기 분자 구분 (python)Y3ADMET 개요 및 Metabolism 데이터 이해N - ADME와 독성간의 상관관계 - 약물 대사 phase I, II, III4Metabolism 예측을 위한 양자 계산 (anaconda, MOPAC)Y5Absorption, Distribution, Excretion 데이터 이해N - 측정 실험 방법과 측정 값의 정의6독성 in vivo 데이터 이해N - 관련 규제 상황 - 규제 가이드라인7변이원성(mutagenesis), 발암성..
0. 목적- 기본 GPT 시스템 vs 구축한 RAG 시스템을 비교 평가하고 싶을 때!1. 데이터 준비- RAGAS 프레임워크를 사용한 QA set이 필요함- 동일한 Question을 태우고 두 시스템의 Answer를 가져옴- RAGAS metric 중 QA 만을 이용하여 계산 가능한 지표 사용Answer semantic similarityAnswer Correctness2. 데이터 요약- 공통 질문, 기본 GPT 시스템 대답, RAG 시스템 대답- 위의 칼럼으로 구성된 데이터 프레임3. 평가 보고서 만들기- ChatGPT 활용- 두 데이터를 첨부한 후 아래의 질문을 넣어줌tbl_default는 기본 GPT 시스템의 평가지표 결과이고 tbl_rag은 RAG 시스템의 평가지표 결과들이야. 동일한 quest..
