[CDM][OMOP-CDM][OHDSI][ATALS] Common Data Model andAnalysis tool: ATLAS

1. Common Data Model (CDM)

2. OHDSI, OMOP-CDM

3. ATLAS

4. Synthetic Data from OHDSI

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1. Common Data Model (CDM)

- 각 의료기관들의 다양한 데이터를 1) ETL 도구와 2) 매핑 도구를 활용하여 동일한 형태의 데이터로 변환

- 변환된 데이터를 이용한 연구를 다 기관에 적용할 수 있음

- OMOP-CDM, Sentinel-CDM 등이 유명함

- 특히 OHDSI의 OMOP-CDM이 선두주자임

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2. OHDSI, OMOP-CDM

- https://www.ohdsi.org/

OHDSI – Observational Health Data Sciences and Informatics

- 전세계적으로 의료분야에서 CDM 선두주자임

- 기본 Table 구조는 아래 그림과 같음

- CDM database는 여러 RDBMS 형태로 존재 가능함 특히 오픈소스인 만큼 PostrgreSQL 많이 쓰임

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3. ATLAS

- CDM DB를 활용해 연구를 할 수 있는 Tool임

- OPEN SOURCE로 OHDSI에서 소스코드 볼 수 있음

- OHDSI URL: https://www.ohdsi.org/software-tools/

- Git: https://github.com/OHDSI/Atlas/wiki

- 데모 홈페이지: https://atlas-demo.ohdsi.org/#/home

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- 로컬 환경에 OMOP-CDM 부터 ATLAS 설치 과정을 잘 정리한 URL

https://itmaya.co.kr/wboard/view.php?wb=tech&idx=29

ITMAYA

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4. Synthetic Data from OHDSI

- 합성데이터 관련해서도 여러 시도들이 이루어 지고 있음

- Synthea, OSIM v5 등, data generation 분야에도 계속 연구가 진행중임

- 관련 서류: https://www.ohdsi.org/wp-content/uploads/2015/04/Synthetic-Data-Generation-OSIM.pdf